Происходил из дворянского рода Слепцовых. Отец, Алексей Васильевич Слепцов, имел 1500 десятин земли и 250 душ в Сердобском уезде Саратовской губернии. Мать Жозефина Адамовна (урожд. Поклонская) была племянницей декабриста К. Г. Игельстрома. Родился он в Воронеже, где в Новороссийском драгунском полку служил его отец, который через год вышел в отставку и поселился с семьёй в Москве. В семье было два сына (Василий и Николай) и пять дочерей (Глафира, София, Екатерина, Анастасия, Лидия).
В 1846 году начал учиться во 2-м классе 1-й московской гимназии, но из-за переезда семьи в Саратовскую губернию, с 1848 года он учился в Дворянском институте в Пензе, который и окончил. Далее учился на медицинском факультете Московского университета (1854), но недолго, ибо через год увлёкся сценой и поступил актёром в Ярославский городской театр (под псевдонимом Лунин). В это время женился на кордебалетной танцовщице Е. А. Цукановой.
По словам Д. Мирского, «дворянин и красавец, Слепцов обладал необыкновенной привлекательностью для противоположного пола; он осуществлял на практике идеалы свободной любви, которые пропагандировало его поколение». От лицедейства он скоро перешёл к изучению народного быта и по предложению этнографического отделения Императорского географического общества, отправился, по тогдашней моде — пешком, во Владимирскую губернию.
В 1857-1862 гг. числился чиновником в канцелярии московского гражданского губернатора, часто бывал в московском литературном салоне графини Салиас-де-Турнемир. Унаследованное имение продал брату и вновь женился (1858) — на Елизавете Николаевне Языковой (дочери поручика). Их первенец умер в младенчестве. Слепцов довольно скоро оставил жену и уехал в Петербург.
Опубликовал несколько очерков из народной жизни в журналах разного направления, включая некрасовский «Современник» и «Северную пчелу». Под влиянием романа «Что делать?» Н. Г. Чернышевского увлёкся практическим решением «женского вопроса» и создал в сентябре 1863 г. известную Знаменскую коммуну, просуществовавшую до июня следующего года. Завершение этой эпопеи, отнявшей у Слепцова много времени и сил, позволило ему уделять больше времени писательской деятельности. В 1865 году он опубликовал в журнале «Современник» сатирическую картину либерального общества эпохи «великих реформ» — роман «Трудное время». Играл ведущую роль в кампании за предоставление молодым женщинам столицы образования, работы и независимости. Организовал общедоступные для женщин лекции по различным наукам. Также организовал переплетную мастерскую для женщин и учредил общественный фонд помощи для обеспечения ее дешевым кредитом.
30 апреля 1866 года Слепцов был арестован по делу Каракозова, который 4 апреля неудачно покушался на жизнь императора Александра II. Никаких доказательств предполагаемой преступной деятельности Слепцова получено не было, и 18 июня 1866 года он был освобождён с оставлением под надзором полиции.
В 1873 году у Слепцова была обнаружена язва прямой кишки (которая была, видимо, первым проявлением рака). В том же году по совету врача оставил литературную деятельность, лечился на Кавказе (в Тифлисе). В 1875 году вернулся в Москву, а весной 1876 года приехал для оперативного лечения в Петербург. Операция прошла удачно, но принесла только временное облегчение. Слепцов уехал в деревню к матери, где и умер 30 марта 1878 года. Дочь его Валентина (26.11.1862 — 17.1.1940, Берлин) была замужем за Иосифом Александровичем Ромейко-Гурко.