Рок (Окадзима Рокуро) был обычным японским бизнесменом, но после череды невероятных событий он присоединился к команде «Компания Лагуна», занимающейся перевозкой грузов по воде и мелкими пиратствами на суше. Вместе с Датчем, Бенни и Реви он бороздит моря Азии на борту модифицированного торпедного катера «Чёрная лагуна».
Их база, город беззаконья Роанапур, находится в шаге от открытой войны, будучи захваченным и контролируемым криминальными группировками со всего мира. Главными в этом сборище являются Балалайка из России и Чанг из Гонконга.
Наша история повествует о Роанапуре незадолго до того, как Рок вместе с Реви возвращается на свою старую родину – Японию.
Эта история рассказывает о солдатах, когда-то воевавших вместе в стране песочных бурь, о воссоединенном личном составе капитана с её бывшими подчинёнными…