Родился в 1964г.
Дизайнер, иллюстратор, график.
Окончил школу-студию МХАТ, по специальности «художник-технолог сцены». Какое-то время работал ассистентом Валерия Яковлевича Левенталя в Большом театре. После почти три года работал художником в Библиотеке иностранной литературы.
Дебютировал как художник книги в 1989 году, оформив сборник статей Константина Кедрова «Поэтический космос»; работал в издательстве «Советский писатель».
За детскую книжку Спайка Миллигана «Чашка по-английски» в переводе Г. Кружкова стал лауреатом Всесоюзного конкурса художников книги в 1991 году. Последним лауреатом в Советском Союзе, потому что потом не стало Советского Союза. Сотрудничал с «Черной курицей», дружил с Левой Яковлевым, Сергеем Седовым.
Ушел во взрослую книгу в 1993 году. Было много графических выставок, предложения поработать в Штатах. Пришел в издательство «Гнозис» и стал делать философские книжки.
Наибольшую известность принесло Бондаренко начавшееся в 2000 году сотрудничество с издательством «Ad Marginem», для которого он создал серию обложек к книгам Владимира Сорокина. Среди других издательств, с которыми многократно работал Бондаренко, — «Эксмо», «АСТ», «Corpus», «Симпозиум», «Иностранка», «ОГИ». Работал с многими книгами Бориса Акунина, русскими изданиями Умберто Эко, Питера Хёга и др.
Удостоен премии «Человек книги» (2005).
Сейчас работает в издательстве CORPUS, бывшем издательстве «Иностранка», куда вслед за В. Горностаевой перешла почти вся редакция.
Его друг, писатель Вильгельм Зон ввел Андрея в роман «Окончательная реальность» в качестве одного из героев.
Лауреат разных премий и конкурсов. Оформил более трех тысяч книг.