Родился в трансильванском селе Решиари в Австро-Венгрии, в семье священника-ортодокса. Учился в немецкой школе. Окончил факультет филологии и философии Бухарестского университета, где и сблизился с Мирчей Элиаде и Эженом Ионеско. Первоначально вся троица тяготела к немецкому культур-пессимизму, к философии Ницше, Шопенгауэра и т.д. Конкретно Чоран увлекался Кантом, Хайдеггером и Клагесом. В 1933-м получив стипендию на обучение в Берлинском Университете лично встретился с Людвигом Клагесом и Николаем Гартманом. Некоторое время поддерживал нацистскую идеологию, и такие группировки как Ночь Длинных Ножей и Железная Стража в Румынии, однако уже в первые годы второй мировой открестился от них и порвал все связи.
В 1935-м в Румынии была опубликована первая книга Эмиля, "На вершинах отчаяния".
Обладатель премий Ривароля, Роже-Нимье и Поля Морана. Сам же Чоран лично принял только премию Ривароля, в дальнейшем упорно отказываясь от всяких литературных премий.
Перебравшись в Париж, остаток жизни прожил в изоляции, предпочитая сводить общение с внешним миром – за исключением немногих близких друзей - к минимуму.
Основные ориентиры в трудах - нигилизм, пессимистическая эстетика, абсурд, экзистенциализм.