Родился в 1956 г. в г. Ниигата. Окончил филологический факультет университета Хосэй в Токио. С 1984 по 1996 г. работал редактором в литературно-критической газете «Тосё симбун». Дебютировал в качестве писателя в 1993 г. романом «Обойди зону слева». Повесть «Полночь в Буэнос-Айресе» получила премию Акутагавы. Среди других произведений — «Сайгонский звукосниматель», «Смертельная игра», «SATORI», «Татуировка». В настоящее время проживает в г. Камакура.
Сю Фудзисава напрямую обращается к темам секса, насилия и наркотиков, жестокий мир его романов, действие которых происходит в современной Японии, напоминает творчество американских писателей У. Берроуза и Ч. Буковски. Однако основу его произведений, даже самых экстремальных, стоящих на грани фантастики, составляет дотошное изучение современного общества.
Для работ Фудзисавы, особенно ранних («Satori», «Обнажить ствол», «Рай со знаком минус»), характерна экстравагантность, а также специфические реалии, заполненные насилием, жестокостью, половыми извращениями и стимулированными наркотиками галлюцинациями; очень часто, его персонажи — маргиналы современного японского общества. Произведения, как правило, лишены ясной структуры, начало и конец слабо мотивированы, а само изложение принципиально двусмысленно и стилистически сильно занижено. Тем не менее, за этими анти-художественными средствами скрывается писательский реализм Фудзисавы, чутко улавливающего цинизм и нигилизм своего поколения. Реалистическое начало литературы Фудзисавы особенно заметно в работах, где эпатажность стиля отодвигается на второй план, уступая место тонкому психологизму, как в новелле «Полночь в Буэнос-Айресе» (1998). Более поздние работы, как роман «Вода камень точит» (1999), развивают эту линию творчества Фудзисавы: центральной темой здесь становится разворачиваемая в предельной обыденности японского быта проблема взаимопонимания между людьми.
Фудзисава часто сравнивается с современным шотландским писателем Ирвином Уэлшем вплоть до распространения в российской комментаторской литературе ярлыка «японский Ирвин Уэлш».